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蔡政府决定明年为军公教调薪4%，并针对公立大专院校助理教授以上、“中研院”相当等级人员专业加给调薪15%，引发中小学教师不满。教团表示，不该独厚特定教职，中小学教师也有学术研究费，应一视同仁，不该有差别待遇，另应调升导师加给、特教加给。

政府这次为军公教加薪，在中小学教师师方面，包括本薪、学术研究费及主管加给均加4%；大学教师则在本薪及主管加给加4%，但学术研究费则加15%。整体来说，中小学教师的薪水是加4%，但大学教师的薪水却加了约1成。

根据台媒报导，全教产理事长林硕杰表示，中小学和大学教师的薪资都包含学术研究费，但加薪幅度却不同，而且差距非常大，这对中小学教师很不公平，也是一种歧视。

另外，林硕杰指出，曾有家长团体说“导师没有下班时间”，各级学校更要求导师，只要学生提早来教室，导师都必须在教室坐镇。但导师加给多年来仅有新台币3000元，特教加给至多1800元，“行政院”才刚核定调高警勤加给，不跟进调整恐有歧视之嫌。

“教育部”表示，中小学导师及特教职务加给调整部分，将视教学现场状况依程序检讨修正。

对于公立大专院校助理教授以上教师，学术研究加给均调整百分之十五，经试算，调升后领取最高薪点正教授月薪约可增加1.1万元，相当于加一成薪，但学界仍认为台湾教授薪资仍大输亚洲邻国，亦比不过产业界。